Второй выход станции «Балтийская» будет спроектирован примерно к 2014 году. Конкурс уже объявлен, бюджет мероприятия составляет 83 млн рублей.
Предположительно, второй выход построят около здания, где раньше располагался Варшавский вокзал. Планируется, что выход станет частью пересадочного узла, а также будет оснащен четырьмя эскалаторами; в подземном вестибюле есть два предусмотренных для этого места: центр зала над боковым тоннелем и торец вестибюля возле мозаики.
После открытия второго выхода нынешний планируется закрыть на капитальный ремонт. Точные даты и сроки пока неизвестны.