Сепсис является основной причиной смертности, и для успешного лечения необходимо быстро и точно определить возбудителя. Распространенность микроорганизмов, вызывающих инфекции кровотока (ИБК), варьируется в зависимости от региона.
Бактериальный сепсис диагностируется на основании факторов, связанных с пациентом, включая температуру, пульс, дыхание, давление, анализы крови и посев крови. Молекулярно-диагностические тесты, такие как мультиплексная ПЦР в реальном времени, быстро выявляют возбудителей и уже внедряются в клинических лабораториях.
Образцы крови содержат ингибиторы ПЦР, такие как ДНК человека и гемоглобин, которые могут привести к осложнениям в молекулярной диагностике. В исследовании, опубликованном в журнале Scientific reports, обозначено, что для улучшения результатов исследователям было важно выбрать эффективный метод концентрирования ДНК и платформу для выделения ДНК.
В результате ученые сравнили точность набора для выделения ДНК K-SL и GraBon с набором QIAamp DNA Blood Mini для кишечной палочки и золотистого стафилококка в образцах цельной крови. Для кишечной палочки K-SL показал самую высокую точность — 77,5%, GraBon — 76,5%, в то время как QIAamp DNA Blood Mini — 65,0%. Для S. aureus точность GraBon составила 77,5%, а K-SL и QIAamp DNA Blood Mini — 67,5%. Различия в точности не были статистически значимыми, указали ученые.
Все три метода дали отрицательные результаты при анализе отрицательных результатов посева крови и плановых медицинских осмотров, что указывает на 100% специфичность.
Эти результаты показывают, что методы, основанные на использовании магнитных частиц, особенно в автоматизированном формате, весьма эффективны для выделения ДНК бактерий из образцов цельной крови.
Такие методы могут значительно ускорить и повысить точность диагностики инфекций, передающихся через кровь, что, в свою очередь, может улучшить результаты лечения пациентов.